নভোএয়ার বর্তমানে প্রতিদিন ঢাকা থেকে চট্টগ্রাম রুটে ৫টি ও বরিশাল রুটে ১টি করে ফ্লাইট পরিচালনা করছে।
যাত্রী চাহিদা থাকায় নতুন পরিকল্পনা অনুযায়ী সকাল ৭টা, ৮টা ৩০ মিনিট, ১১টা ২০ মিনিট, দুপুর ২টা, বিকাল ৩টা ৫০ মিনিট ও সন্ধ্যা ৬টা ৪৫ মিনিটে ঢাকা থেকে চট্টগ্রামের উদ্দেশে ছেড়ে যাবে নভোএয়ারের উড়োজাহাজ।
একইভাবে চট্টগ্রাম থেকে সকাল ৮টা ২০ মিনিট, ৯টা ৫৫ মিনিট, দুপুর ১২টা ৪৫ মিনিট, বিকাল ৩টা ২৫ মিনিট, ৫টা ১৫ মিনিট ও রাত ৮টা ১০ মিনিটে ঢাকার উদ্দেশে ছেড়ে আসবে এই সংস্থার বিমান।
এছাড়া ঢাকা থেকে সকাল ৯টা ও বিকাল ২টা ৫০ মিনিটে বরিশালের উদ্দেশে আর বরিশাল থেকে সকাল ১০টা ১০ মিনিট ও বিকাল ৪টায় ঢাকার পথে রওনা দেবে নভোএয়ারের ফ্লাইট।
এসব রুট ছাড়াও বর্তমানে প্রতিদিন কক্সবাজার রুটে ৬টি, সৈয়দপুর ও যশোর রুটে ৫টি করে, সিলেট রুটে ২টি এবং রাজশাহী ও কলকাতায় ১টি করে ফ্লাইট পরিচালনা করছে নভোএয়ার।